由于各種天然水體都存在溶解性二氧化碳（分子式CO2）氣體，部分CO2與水會反應生成碳酸，有部分碳酸會發生電離。

　　從可逆的化學平衡知道，在密閉的體系內，CO2、HCO3－和CO32－的相對含量隨pH值的變化而變化，低pH值條件下，CO2占主要部份，在中等pH值范圍內，主要為HCO3－，高pH值范圍內，主要為CO32－。

　　由于RO膜可以脫除溶解性的離子而不能脫除溶解性的氣體，RO產水中的CO2含量與RO進水中CO2的含量基本相同，但是HCO3－和CO32－常常能夠減少1~2個數量級，這樣就會打破進水中CO2、HCO3－和CO32－之間的平衡，在系列反應中，CO2將與H2O結合發生如下反應平衡的轉移，直到建立新的平衡：

　　CO2+H2O?H++HCO3－

　　如果進水中含有CO2，則RO的產水pH值總會下降，對于大多數RO系統反滲透產水的pH值將有1~2個pH值的下降，當進水堿度和HCO3－高時，產水的pH值下降就更大，這就是GB6682-2008規定的實驗室純水PH值范圍是5.0-7.5的原因，也表明純水偏酸是正常現象，相反純水若偏堿反倒不正常，也不滿足國家實驗室用水標準。但為數極少的進水只含較少的CO2、HCO3－或CO32－，這樣的話產水pH值的變化就相對較小，但產出RO水也仍然是偏酸的。